被公司违法辞退员工拿到的补偿金通常情况下不交个人所得税，可是，违法辞退的补偿金，跟员工的工资所得及工作年限都有关系，如果经济补偿金已经超过了上年度职工平均工资的三倍，超过的部分是需要交纳个税的。公司辞退员工的补偿金一般是不交个人所得税的。
国家规定了对劳动者取得的一次性经济补偿金和赔偿金征收个人所得税的最低标准，只有超过该标准的数额，再按照劳动者在用人单位工作的实际年限进行平均后，才向劳动者征收个人所得税。具体标准如下：
(一)以当地上年职工平均工资3倍数额为标准，低于该数额的，劳动者无需缴纳个人所得税;高于该数额的，劳动者需要缴纳个人所得税。
(二)劳动者取得的一次性经济补偿金等收入高于当地上年职工平均工资3倍的，用高出的数额除以劳动者在用人单位的工作年限(劳动者在用人单位的工作年限超过12年的，按照12年计算)，所得数额视为劳动者个人的月工资或薪金收入，对该数额超过2000元的部分征收个人所得税。
个人因与用人单位解除劳动关系而取得的一次性补偿收入(包括用人单位发放的经济补偿金、生活补助费和其他补助费用)，其收入在当地上年职工平均工资三倍数额以内的部分，免征个人所得税;超过的部分按照《国家税务总局关于个人因解除劳动合同取得经济补偿金征收个人所得税问题的通知》计算征收个人所得税。
经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算;不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
所称月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。
用人单位违反《劳动合同法》规定不与劳动者订立无固定期限劳动合同的，自应当订立无固定期限劳动合同之日起向劳动者每月支付二倍的工资。
我国的法律法规是严格的保护我国的劳动者的权益的，需要注意的是，劳动关系中补偿金是否要交个人所得税的这个问题是不能一概而论的，而且公司所在地上年度职工的平均工资每年可能都在发生着变化，用人单位也不能违法代扣个税。